祁雨误服毒药，导致身体状况日益恶化，云仙想出用木屑入药的方法治疗。治疗期间，云仙自己也晕倒在医院，程存霞担心其胎儿衰竭。祁雨最终康复，向英宗忏悔并得到原谅。
祁雨为了对付云仙和英宗的亲密关系，撤走了南宫所有的宦官和宫女，降低了英宗皇帝的称号。同时，王美琳皇后也打算对付尹铉。祁雨想让云仙进宫，但云仙却不想。祁雨担心云仙吐血晕倒，去看望了她并告诉了她一个秘密。
云仙和祁雨的感情受到了很多波折，云仙落水后被安顿在宫中，祁雨封她为平妃。在新婚之夜，齐豫把王梅林一个人留在了空房间。皇帝想动用亲征，朝臣反对。王梅林试图伤害云仙。
故事围绕着杭州将军的女儿杭云仙展开。在朝廷的危机斗争中，云仙和齐豫相爱，但遭到徐侍郎的迫害。云仙为保护亲人而落水，生死未卜。皇帝的兄弟祁雨也因此受到打击。
齐豫为了和皇帝取得联系，生了一个聪明的计划。皇帝再一次出宫，希望能见到云仙，从紫苏得知云仙对罗大婶的惨死感到痛心，于是攻击云仙。祁雨被皇帝误会对王梅林有恩，但很快否认自己有心上人。景慈大师邀请云仙来治疗寺里的流民，但云仙一直没能走出自己的“杀人”阴影中。
女主角云仙救人受惊，被齐豫救助，结识俞大人并被收养，被邀请到于府拜访。祁雨拒绝太后立他为新王，太后下手报复。
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